19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3645 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3645  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  344  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52617  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  41.72 
 
 
166 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0375  putative bile acid 7-alpha dehydratase  40 
 
 
171 aa  92.8  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1548  hypothetical protein  37.04 
 
 
151 aa  84.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  33.12 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  30.14 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4186  hypothetical protein  31.94 
 
 
170 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.210187 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  29.93 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  32.06 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7188  hypothetical protein  27.86 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168742  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  29.93 
 
 
163 aa  51.2  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  28.48 
 
 
187 aa  48.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  33.6 
 
 
163 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  33.07 
 
 
160 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  26.22 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  32.54 
 
 
154 aa  44.7  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  32.03 
 
 
158 aa  44.3  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  31.43 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  30.16 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>