40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2716 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2716  Phage uncharacterized protein-like  100 
 
 		 458 aa  939    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1896  hypothetical protein  50.34 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3043  protein of unknown function DUF264  44.34 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0633  hypothetical protein  40.83 
 
 		 509 aa  307  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3628  hypothetical protein  47.04 
 
 		 690 aa  273  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3704  hypothetical protein  52.28 
 
 		 446 aa  193  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2102  protein of unknown function DUF264  47.52 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000296249  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1074  hypothetical protein  32.85 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541704  normal  0.984253 
 
 
-
 
NC_004310  BR0585  terminase large subunit, putative  47.45 
 
 		 384 aa  155  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1330  large terminase  45.41 
 
 		 459 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0902  hypothetical protein  56.95 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225304 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2902  hypothetical protein  43.2 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176162  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3490  hypothetical protein  44.67 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1408  hypothetical protein  43.15 
 
 		 422 aa  152  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1057  hypothetical protein  46.57 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0533808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1964  hypothetical protein  44.16 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.817651 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3118  hypothetical protein  51.27 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0586  putative terminase large subunit  47.45 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3147  hypothetical protein  48.82 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284595  normal  0.0189351 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2178  hypothetical protein  46.27 
 
 		 452 aa  149  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3472  hypothetical protein  46.15 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1976  hypothetical protein  45.13 
 
 		 370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.493623  normal  0.545091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1708  protein of unknown function DUF264  45.18 
 
 		 421 aa  147  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.0322658 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1160  hypothetical protein  42.35 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1129  hypothetical protein  43.11 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2467  putative large terminase  43.11 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1800  hypothetical protein  42.71 
 
 		 423 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4961  hypothetical protein  43.18 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000421894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1430  protein of unknown function DUF264  46.7 
 
 		 421 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.396368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1631  hypothetical protein  39.09 
 
 		 483 aa  141  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576046  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3918  hypothetical protein  50.28 
 
 		 439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0145321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1434  hypothetical protein  42.53 
 
 		 458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2004  hypothetical protein  32.36 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0120622 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0918  hypothetical protein  32.47 
 
 		 450 aa  113  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0384  hypothetical protein  56.9 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.22896  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2464  hypothetical protein  35.2 
 
 		 140 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3888  hypothetical protein  34.22 
 
 		 496 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0896  hypothetical protein  24.68 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3483  hypothetical protein  25 
 
 		 453 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0848  PBSX family phage terminase large subunit  26.54 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00062306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>