30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2700 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2700  Phage-related protein endonuclease-like  100 
 
 		 303 aa  620  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  28.29 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  30.08 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  28.74 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  26.89 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  28.63 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  26.88 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  27.95 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  30.19 
 
 		 334 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1345  Phage-related protein endonuclease-like protein  27.84 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000265319  decreased coverage  0.000101887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2639  phage-related protein endonuclease-like protein  30.83 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  27.41 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  27.75 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3414  Phage-related protein endonuclease-like protein  27.24 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0329559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3585  hypothetical protein  32.13 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  28.24 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3048  phage-related protein predicted endonuclease-like protein  30 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.0334909 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  26.32 
 
 		 331 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0982  hypothetical protein  24.66 
 
 		 338 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000285055  hitchhiker  0.0000282178 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  26.24 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  26.12 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6282  phage-related protein endonuclease-like protein  31.27 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.43147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6976  phage-related protein endonuclease-like protein  30.94 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0938  hypothetical protein  26.34 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  27.17 
 
 		 311 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0591  hypothetical protein  24.81 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4068  Phage-related protein endonuclease-like  22.22 
 
 		 334 aa  49.3  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  23.32 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  24.87 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0602  phage-type endonuclease  24.74 
 
 		 247 aa  42.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>