11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2299 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2299  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  243  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2832  hypothetical protein  42.24 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151982  normal  0.205278 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  32.93 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  32.93 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  30.95 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  31.71 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  31.71 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  31.71 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  27.37 
 
 
157 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  31.46 
 
 
387 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>