156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1955 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1955  colicin V production protein  100 
 
 		 184 aa  363  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1805  colicin V production protein  43.71 
 
 		 178 aa  141  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4093  colicin V production protein  45.73 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1500  colicin V production protein  30.72 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3500  Colicin V production protein  29.7 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2453  colicin V production protein  28.48 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0414  Colicin V production protein  25 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.728843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  26.22 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  33.64 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2996  colicin V production protein  29.09 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  30.91 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0454  putative colicin V production protein  27.72 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0448  colicin V production protein, putative  27.88 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0405  colicin V production protein  29.63 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  27.27 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0728  colicin V production protein  27.61 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.980387  normal  0.959798 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  26.22 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4630  Colicin V production protein  31.79 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.202655  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  27.27 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3895  colicin V production protein  31.9 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507461  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  20.57 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3933  colicin V production protein  30.18 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.838461  normal  0.0661094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4408  Colicin V production protein  30.18 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  30.34 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4301  Colicin V production protein  30.18 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.678611  normal  0.0583187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3788  putative colicin V production protein, cvpA-like (dedE protein) (Pur regulon 18 kDa protein)  27.5 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0561  colicin V production protein  27.65 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245346  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0984  colicin V production protein  28.66 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2598  colicin V production protein  31.13 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402841  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  27.83 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  27.59 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  30.77 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1188  Colicin V production protein  28.66 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  29.91 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  27.74 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  29.45 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  27.74 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  28.47 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  28.99 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1043  Colicin V production protein  28.05 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  27.89 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  28.99 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  27.74 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  26.79 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  27.08 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  26.79 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  26.95 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  27.08 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  27.08 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  28.47 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  27.21 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  27.21 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  28.47 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  28.47 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  28.77 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  27.21 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  28.95 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  29.71 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0264  colicin V production protein  27.05 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  26.53 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  30.89 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  26.53 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  26.53 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  26.53 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  26.53 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  27.19 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  29.63 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  29.63 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1973  CvpA family protein  29.09 
 
 		 155 aa  51.6  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  26.81 
 
 		 162 aa  51.6  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3486  colicin V production protein  29.73 
 
 		 232 aa  51.6  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692742 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0763  CvpA family protein  33.96 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  29.17 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2301  CvpA family protein  33.96 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  27.83 
 
 		 177 aa  51.2  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1715  CvpA family protein  33.02 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1258  Colicin V production protein  30.91 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0685  CvpA family protein  32.08 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  29.27 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2879  Colicin V production protein  29.57 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.111961 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1655  CvpA family protein  33.02 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1864  CvpA family protein  33.02 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2439  CvpA family protein  33.02 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267781  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0535  CvpA family protein  33.02 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0960  colicin V production protein  31.18 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0660005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3760  Colicin V production protein  27.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1051  colicin V production protein  31.18 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0875  colicin V production protein  36.13 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.592724  normal  0.0357413 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  30.84 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  29.31 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  30.84 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  30.84 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  28.08 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  29.05 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  25.36 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  28.7 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  25.36 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1206  colicin V production protein  29.09 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  25.36 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  25.36 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>