16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1084 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1084  hypothetical protein  100 
 
 
60 aa  125  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1133  hypothetical protein  78.95 
 
 
83 aa  96.7  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.433125  normal  0.699348 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4321  hypothetical protein  74.14 
 
 
59 aa  93.6  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2679  hypothetical protein  67.24 
 
 
58 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  50.88 
 
 
62 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  50.88 
 
 
62 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0113  hypothetical protein  45.61 
 
 
62 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  45.1 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3560  hypothetical protein  37.29 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  46.94 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  41.67 
 
 
62 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  43.33 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  41.67 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  41.38 
 
 
58 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  43.4 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  44.9 
 
 
110 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>