14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4646 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4646  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  352  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0250734  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5077  hypothetical protein  42.45 
 
 
168 aa  117  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8935  hypothetical protein  43.17 
 
 
179 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00543582  normal  0.426829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3237  hypothetical protein  36.69 
 
 
173 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3101  hypothetical protein  37.86 
 
 
169 aa  99  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148369  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4703  hypothetical protein  35.71 
 
 
168 aa  95.1  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0124469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4198  hypothetical protein  37.67 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912124  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26760  hypothetical protein  33.96 
 
 
178 aa  84.7  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14308  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0122  hypothetical protein  34.03 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0152  hypothetical protein  31.98 
 
 
170 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1549  hypothetical protein  28.15 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0808591  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4209  hypothetical protein  27.86 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4211  hypothetical protein  27.2 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4282  hypothetical protein  29.55 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>