18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4190 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4190    100 
 
 		 435 bp  862    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5077    89.86 
 
 		 226 bp  163  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3175  transposase, IS4  91.18 
 
 		 141 bp  131  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2598    87.2 
 
 		 1184 bp  121  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383932  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2753  transposase  89.32 
 
 		 897 bp  117  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2794  transposase IS4 family protein  89.32 
 
 		 1257 bp  117  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2502    86.89 
 
 		 1273 bp  115  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1763  putative transposase  88.57 
 
 		 1308 bp  113  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1728  putative transposase  88.57 
 
 		 1299 bp  113  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.579187  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4393    88.76 
 
 		 1240 bp  97.6  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1609  transposase IS4 family protein  84.3 
 
 		 1239 bp  89.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.200563  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2535  transposase IS4 family protein  84.3 
 
 		 1239 bp  89.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011121  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2537  transposase IS4 family protein  84.3 
 
 		 1239 bp  89.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000138999  hitchhiker  0.00019554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4227  transposase, IS4  83.5 
 
 		 1299 bp  69.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1089  transposase, IS4  83.5 
 
 		 1173 bp  69.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6409    94.12 
 
 		 624 bp  52  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6980    84.62 
 
 		 144 bp  50.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3970  transposase IS4 family protein  96.43 
 
 		 1605 bp  48.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>