16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3101 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3101  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  348  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148369  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5077  hypothetical protein  41.14 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4198  hypothetical protein  42.65 
 
 
174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912124  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4703  hypothetical protein  36.77 
 
 
168 aa  99.4  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0124469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3237  hypothetical protein  34.59 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0122  hypothetical protein  36.91 
 
 
167 aa  90.9  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4646  hypothetical protein  37.86 
 
 
174 aa  89  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0250734  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26760  hypothetical protein  37.96 
 
 
178 aa  86.7  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14308  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0152  hypothetical protein  34.88 
 
 
170 aa  82  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1549  hypothetical protein  37.31 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0808591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8935  hypothetical protein  30.26 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00543582  normal  0.426829 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4211  hypothetical protein  35.24 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4209  hypothetical protein  31.43 
 
 
160 aa  54.3  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4024  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  51.2  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1948  hypothetical protein  30.1 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.841214  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4514  hypothetical protein  27.21 
 
 
178 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.317582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>