13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2668 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2485  hypothetical protein  87.89 
 
 
455 aa  782    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2668  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  902    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.519412  decreased coverage  0.0000451664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0461  hypothetical protein  26.23 
 
 
450 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09860  hypothetical protein  23.47 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726307  normal  0.031392 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1305  hypothetical protein  30.59 
 
 
454 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.364108  normal  0.63665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4992  hypothetical protein  25.07 
 
 
454 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4830  hypothetical protein  23.15 
 
 
453 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  28.02 
 
 
465 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08410  hypothetical protein  22.16 
 
 
444 aa  47.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1313  glutathionylspermidine synthase  19.81 
 
 
410 aa  46.6  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08440  hypothetical protein  25.7 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.696595  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2104  hypothetical protein  22.99 
 
 
455 aa  43.9  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170705  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0111  protein of unknown function DUF407  26.24 
 
 
462 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500585  normal  0.341052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>