17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2441 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2441  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  270  6e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.655393  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4417  nuclear transport factor 2  37.5 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1249  hypothetical protein  44.76 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.64479  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1592  nuclear transport factor 2  36.29 
 
 		 144 aa  84.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5165  nuclear transport factor 2  35.88 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3969  hypothetical protein  31.97 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15097  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3853  hypothetical protein  31.45 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4586  nuclear transport factor 2  31.75 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10775  hypothetical protein  33.08 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4674  nuclear transport factor 2  31.75 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4969  nuclear transport factor 2  32.58 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2031  putative ketosteroid isomerase  25.64 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4985  steroid delta-5-3-ketosteroid isomerase  27.45 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3185  nuclear transport factor 2  42.86 
 
 		 268 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572325  normal  0.409809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3259  protein of unknown function DUF1486  27.21 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0164408  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12079  hypothetical protein  34.92 
 
 		 265 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3431  nuclear transport factor 2  24.32 
 
 		 267 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>