17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2694 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2694  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  330  5e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03856  hypothetical protein  45.91 
 
 		 147 aa  128  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.857117  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0764  hypothetical protein  47.37 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.503732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0620  hypothetical protein  45.75 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4061  hypothetical protein  38.22 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3166  hypothetical protein  42.95 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2513  hypothetical protein  42.95 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1023  hypothetical protein  38.89 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61000  hypothetical protein  41.83 
 
 		 144 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5250  hypothetical protein  41.29 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13541  hypothetical protein  37.18 
 
 		 147 aa  90.9  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3627  hypothetical protein  36.63 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105374  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  32.77 
 
 		 364 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2795  hypothetical protein  32.41 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  36.11 
 
 		 697 aa  41.6  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3242  hypothetical protein  31.43 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4251  hypothetical protein  28.95 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.215178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>