13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2648 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2648  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  759    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.335863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4378  hypothetical protein  48.08 
 
 		 377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4376  hypothetical protein  37.8 
 
 		 372 aa  232  8.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2646  hypothetical protein  33.15 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2936  hypothetical protein  21.43 
 
 		 399 aa  93.2  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.087156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4008  DGQHR domain protein  25.72 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0820  hypothetical protein  24.26 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1367  hypothetical protein  26.25 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5365  hypothetical protein  22.48 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.383398  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3948  hypothetical protein  25.82 
 
 		 769 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0773653  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3315  hypothetical protein  23.49 
 
 		 396 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.607965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6301  DGQHR domain protein  24.83 
 
 		 341 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5364  dgqhr domain, putative  20.11 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00112858  hitchhiker  0.00000000329618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>