13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2003 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2003  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  440  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212365  normal  0.0101552 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  35.25 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  33.1 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  32.41 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  30.34 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  32.41 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  31.72 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  25.6 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  31.72 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  30.34 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2568  hypothetical protein  29.03 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  27.45 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  46.34 
 
 		 388 aa  42  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>