29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1777 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1777  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  170  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256897  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2916  hypothetical protein  64.29 
 
 
82 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.0883091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3327  hypothetical protein  65.48 
 
 
82 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86974  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1574  hypothetical protein  64.29 
 
 
82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2917  hypothetical protein  65.38 
 
 
84 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.862357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2375  hypothetical protein  68.12 
 
 
73 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0792048  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2919  hypothetical protein  61.43 
 
 
179 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3249  hypothetical protein  68.85 
 
 
71 aa  93.6  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0322757  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4037  hypothetical protein  54.76 
 
 
82 aa  91.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0386053 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3433  hypothetical protein  54.79 
 
 
77 aa  82.8  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14303  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0127  hypothetical protein  56.72 
 
 
90 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00495666  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0811  hypothetical protein  56.45 
 
 
77 aa  77  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1139  hypothetical protein  45.45 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2869  hypothetical protein  45.07 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1231  hypothetical protein  45.12 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4103  hypothetical protein  52.31 
 
 
78 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.918286  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2432  hypothetical protein  47.69 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2980  hypothetical protein  43.94 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1434  hypothetical protein  46.97 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3623  hypothetical protein  53.57 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4275  hypothetical protein  40.79 
 
 
79 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532653  normal  0.601848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1907  hypothetical protein  40 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0497994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2643  hypothetical protein  41.27 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1935  hypothetical protein  36.59 
 
 
90 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.795864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4993  hypothetical protein  31.08 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  0.0403555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2603  hypothetical protein  30.99 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355164  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0949  hypothetical protein  30 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000036055  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1209  hypothetical protein  40.62 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4439  hypothetical protein  29.89 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>