14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1766 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1766  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  274  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10276  hypothetical protein  44.21 
 
 		 377 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0333  hypothetical protein  47.19 
 
 		 378 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0405  hypothetical protein  46.32 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4464  hypothetical protein  38.75 
 
 		 402 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0650675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1896  hypothetical protein  37.04 
 
 		 412 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0958  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 394 aa  50.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.227106  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1590  hypothetical protein  37.5 
 
 		 396 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.895385  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1614  hypothetical protein  37.5 
 
 		 396 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1560  hypothetical protein  37.5 
 
 		 396 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.98417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1015  hypothetical protein  38.1 
 
 		 401 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3408  hypothetical protein  37.93 
 
 		 417 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1118  alpha/beta hydrolase fold  41.86 
 
 		 380 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4652  hypothetical protein  29.6 
 
 		 393 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>