14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1349 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1349  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  478  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0095  hypothetical protein  32.6 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2090  hypothetical protein  33.59 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3402  hypothetical protein  41.49 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.572475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  33.04 
 
 		 336 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  33.66 
 
 		 479 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  27.42 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  24.84 
 
 		 317 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  24.84 
 
 		 317 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1348  hypothetical protein  32.52 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.293308  normal  0.0280639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  24.84 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  41.51 
 
 		 335 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  26.67 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1400  hypothetical protein  30.71 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.452797  normal  0.148834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>