72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3823 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009036  Sbal_4437  transposase, mutator type  94.13 
 
 		 1170 bp  1241    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.32044  normal  0.434344 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2418  ISSod5, transposase  96.61 
 
 		 1206 bp  1818    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3360  ISSod5, transposase  97.17 
 
 		 1206 bp  1865    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3823    100 
 
 		 1122 bp  2224    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3878  ISSod5, transposase  97.27 
 
 		 1206 bp  1873    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4284  ISSod5, transposase  98.68 
 
 		 1206 bp  1992    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4497  ISSod5, transposase  97.08 
 
 		 1206 bp  1857    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4534    99.3 
 
 		 432 bp  553  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3038    89.53 
 
 		 252 bp  220  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0104  hypothetical protein  100 
 
 		 126 bp  123  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3753    100 
 
 		 777 bp  121  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0364  transposase, mutator type  80.85 
 
 		 1203 bp  87.7  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2176  transposase, mutator type  80.85 
 
 		 1203 bp  87.7  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2058  transposase, mutator type  79.79 
 
 		 1203 bp  71.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3720  transposase, mutator type  79.79 
 
 		 1203 bp  71.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3078  transposase mutator type  95.12 
 
 		 1203 bp  65.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2320    100 
 
 		 1308 bp  65.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2291  hypothetical protein  100 
 
 		 375 bp  65.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0101    84.72 
 
 		 1119 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.652093  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1767  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4165  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4259  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4386  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1540    84.72 
 
 		 1101 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4545  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4582  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4707  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0064    84.72 
 
 		 909 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.131206  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0083  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.21164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2321  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0103    84.72 
 
 		 2550 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.784362  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0144  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.713152  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1269  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1026  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0893    84.72 
 
 		 1224 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0596  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0378  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0356  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3451  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2316    84.72 
 
 		 1191 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2292  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2811  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3044  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3399  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3443  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3824  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3522  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3566    84.72 
 
 		 1101 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3604  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3752  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2078  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1875  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3712  ISSod4, transposase  84.72 
 
 		 1203 bp  56  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1109    84.85 
 
 		 543 bp  52  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4397  hypothetical protein  93.94 
 
 		 549 bp  50.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0130  ISSod4, transposase  85 
 
 		 1203 bp  48.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.163487  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3858  ISSod4, transposase  83.33 
 
 		 1203 bp  48.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00238  transposase, Mutator family  86.54 
 
 		 786 bp  48.1  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2344  ISSod4, transposase  85 
 
 		 1203 bp  48.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2392  ISSod4, transposase  83.33 
 
 		 1203 bp  48.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3876  ISSod4, transposase  83.33 
 
 		 1203 bp  48.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2817  ISSod4, transposase  83.33 
 
 		 1203 bp  48.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1268    88.64 
 
 		 1225 bp  48.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0611207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3882  ISSod4, transposase  83.33 
 
 		 1203 bp  48.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1280    85 
 
 		 717 bp  48.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2272  ISSod4, transposase  83.33 
 
 		 1203 bp  48.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3944  ISSod4, transposase  83.33 
 
 		 1203 bp  48.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4024  ISSod4, transposase  83.33 
 
 		 1203 bp  48.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0035  ISSod4, transposase  83.33 
 
 		 1203 bp  48.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.988899  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3518  ISSod4, transposase  83.33 
 
 		 1203 bp  48.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1616  ISSod4, transposase  83.33 
 
 		 1203 bp  48.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1438  ISSod4, transposase  83.33 
 
 		 1203 bp  48.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>