More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2418 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2418  ISSod5, transposase  100 
 
 
401 aa  830    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3360  ISSod5, transposase  98.75 
 
 
401 aa  823    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3878  ISSod5, transposase  98 
 
 
401 aa  817    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4284  ISSod5, transposase  98.5 
 
 
401 aa  822    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4497  ISSod5, transposase  98.25 
 
 
401 aa  820    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4437  transposase, mutator type  95.01 
 
 
389 aa  784    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.32044  normal  0.434344 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2292  ISSod4, transposase  71.82 
 
 
400 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0356  ISSod4, transposase  71.32 
 
 
400 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0378  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0596  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1026  ISSod4, transposase  71.32 
 
 
400 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1269  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1438  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1616  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1767  ISSod4, transposase  71.32 
 
 
400 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1875  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2078  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2272  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2321  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2344  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2392  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2811  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2817  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3044  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3399  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3443  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3451  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3518  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3522  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3604  ISSod4, transposase  71.32 
 
 
400 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3712  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3752  ISSod4, transposase  71.32 
 
 
400 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3824  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3858  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3876  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3882  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3944  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4024  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4165  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4259  ISSod4, transposase  71.32 
 
 
400 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4386  ISSod4, transposase  71.32 
 
 
400 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4545  ISSod4, transposase  71.32 
 
 
400 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4582  ISSod4, transposase  71.32 
 
 
400 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4707  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0035  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.988899  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0083  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.21164  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0130  ISSod4, transposase  71.07 
 
 
400 aa  607  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.163487  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0144  ISSod4, transposase  71.57 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.713152  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4677  transposase mutator type  68.92 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2058  transposase, mutator type  70.82 
 
 
400 aa  609  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4398  transposase mutator type  68.92 
 
 
400 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0364  transposase, mutator type  70.57 
 
 
400 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2176  transposase, mutator type  70.57 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3720  transposase, mutator type  70.57 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3078  transposase mutator type  71.57 
 
 
400 aa  588  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2050  transposase, mutator type  65.66 
 
 
399 aa  565  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0253  IS256 family transposase  52.33 
 
 
410 aa  447  1.0000000000000001e-124  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0155  hypothetical protein  46.15 
 
 
408 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  45.57 
 
 
403 aa  378  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  46.43 
 
 
402 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  46.43 
 
 
402 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  46.68 
 
 
402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  41.98 
 
 
404 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  41.98 
 
 
404 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  41.98 
 
 
404 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  41.98 
 
 
404 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  41.98 
 
 
404 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>