More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2058 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0356  ISSod4, transposase  94 
 
 		 400 aa  793    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0378  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0596  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1026  ISSod4, transposase  94 
 
 		 400 aa  793    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1269  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1438  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1616  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1767  ISSod4, transposase  94 
 
 		 400 aa  793    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1875  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2078  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2272  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2292  ISSod4, transposase  94 
 
 		 400 aa  792    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2321  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2344  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2392  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2811  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2817  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3044  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3399  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3443  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3451  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3518  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3522  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3604  ISSod4, transposase  94 
 
 		 400 aa  793    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3712  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3752  ISSod4, transposase  94 
 
 		 400 aa  793    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3824  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3858  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3876  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3882  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3944  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4024  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4165  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4259  ISSod4, transposase  94 
 
 		 400 aa  793    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4386  ISSod4, transposase  94 
 
 		 400 aa  793    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4545  ISSod4, transposase  94 
 
 		 400 aa  793    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4582  ISSod4, transposase  94 
 
 		 400 aa  793    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4707  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0035  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.988899  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0083  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.21164  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0130  ISSod4, transposase  93.75 
 
 		 400 aa  792    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.163487  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0144  ISSod4, transposase  94.25 
 
 		 400 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.713152  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0364  transposase, mutator type  98.75 
 
 		 400 aa  825    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2058  transposase, mutator type  100 
 
 		 400 aa  836    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2176  transposase, mutator type  99 
 
 		 400 aa  826    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3720  transposase, mutator type  99 
 
 		 400 aa  826    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4677  transposase mutator type  72.11 
 
 		 400 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4398  transposase mutator type  72.11 
 
 		 400 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3078  transposase mutator type  73.5 
 
 		 400 aa  623  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4284  ISSod5, transposase  71.32 
 
 		 401 aa  614  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3360  ISSod5, transposase  71.32 
 
 		 401 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3878  ISSod5, transposase  71.07 
 
 		 401 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4497  ISSod5, transposase  71.07 
 
 		 401 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2050  transposase, mutator type  71.36 
 
 		 399 aa  611  9.999999999999999e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2418  ISSod5, transposase  70.82 
 
 		 401 aa  609  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4437  transposase, mutator type  68.83 
 
 		 389 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.32044  normal  0.434344 
 
 
-
 
NC_002978  WD0253  IS256 family transposase  56.88 
 
 		 410 aa  473  1e-132  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0155  hypothetical protein  49.6 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  46.06 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  46.06 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  46.06 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  45.55 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  45.55 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  45.55 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  45.55 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  45.55 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  45.55 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  48.35 
 
 		 408 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  48.35 
 
 		 408 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  45.55 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1079  transposase mutator type  47.31 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120456  normal  0.0282753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0888  transposase mutator type  47.31 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  45.55 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1824  transposase, mutator type  50 
 
 		 403 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  47.83 
 
 		 408 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  47.83 
 
 		 408 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1218  transposase, mutator type  46.58 
 
 		 411 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  47.83 
 
 		 408 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  47.83 
 
 		 408 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  47.83 
 
 		 408 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  45.82 
 
 		 403 aa  388  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  47.57 
 
 		 408 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  47.83 
 
 		 408 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0630  ISCpe3, transposase  45.34 
 
 		 407 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  48.65 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  48.65 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  48.65 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  48.38 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  48.38 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  48.38 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  48.38 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  48.11 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  48.38 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  48.38 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  48.38 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  48.38 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  48.38 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  48.38 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  48.38 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  48.38 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0142554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>