32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1365 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1365  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2830  hypothetical protein  95.5 
 
 		 111 aa  191  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.616543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3009  hypothetical protein  95.5 
 
 		 111 aa  191  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2912  hypothetical protein  95.5 
 
 		 111 aa  189  9e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3095  hypothetical protein  87.39 
 
 		 111 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.038994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1295  hypothetical protein  87.39 
 
 		 111 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1262  hypothetical protein  87.39 
 
 		 111 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1218  hypothetical protein  87.39 
 
 		 111 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1176  hypothetical protein  86.49 
 
 		 111 aa  173  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1262  hypothetical protein  56.76 
 
 		 111 aa  127  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2914  hypothetical protein  50.45 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2748  hypothetical protein  50.91 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1167  hypothetical protein  55.86 
 
 		 111 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1057  hypothetical protein  47.52 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.455459  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1071  hypothetical protein  52.25 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0897  hypothetical protein  39.81 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.787189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  32.43 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  32.29 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  34.38 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  31.58 
 
 		 130 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  31.58 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  32.32 
 
 		 129 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  25 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  29.73 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  29.73 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  29.73 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  30.21 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  32.63 
 
 		 131 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>