20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2562 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2726  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  253  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2562  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 124 aa  253  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2603  putative cytoplasmic protein  99.19 
 
 		 124 aa  251  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.715844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2615  hypothetical protein  99.19 
 
 		 124 aa  251  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2515  putative cytoplasmic protein  97.58 
 
 		 124 aa  246  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0650  transposase  48.08 
 
 		 667 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0686157  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0787  transposase  48.08 
 
 		 667 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000128606  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2654  transposase, putative  48.21 
 
 		 669 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3972  hypothetical protein  32.5 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000267115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3759  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  32.5 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00050742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3614  hypothetical protein  32.5 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3546  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  26.5 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0216  transposase  41.67 
 
 		 684 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1050  putative repressor protein  27.87 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.678331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3362  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  30.1 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000035442  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3482  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  27.73 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000591006  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3363  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  25.83 
 
 		 128 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000382153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3483  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  25.58 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000503276  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0555  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  24.79 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0791  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  28.1 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000168449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>