28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1710 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1746  putative virulence effector protein  99.02 
 
 		 714 aa  1444    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1565  putative virulence effector protein  98.46 
 
 		 714 aa  1435    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1713  putative virulence effector protein  98.04 
 
 		 714 aa  1429    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2110  putative virulence protein  56.93 
 
 		 726 aa  787    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.867276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1710  putative virulence effector protein  100 
 
 		 714 aa  1456    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1775  putative virulence effector protein  99.44 
 
 		 714 aa  1448    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.837936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2095  putative virulence factor  29.65 
 
 		 820 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180077  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2383  Virulence effector, SrfC  29.33 
 
 		 815 aa  323  7e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.971346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2100  putative virulence factor  30.14 
 
 		 844 aa  320  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1880  putative virulence factor  30.64 
 
 		 832 aa  313  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1842  hypothetical protein  28.69 
 
 		 846 aa  293  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1433  putative virulence factor  28.17 
 
 		 743 aa  237  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2284  hypothetical protein  29.86 
 
 		 674 aa  237  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.869648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1952  putative virulence factor  29.86 
 
 		 679 aa  237  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52070  hypothetical protein  28.36 
 
 		 910 aa  186  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4238  hypothetical protein  29.81 
 
 		 881 aa  172  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1844  hypothetical protein  28 
 
 		 893 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0469  Virulence effector, SrfC  28.41 
 
 		 888 aa  158  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2631  hypothetical protein  26.22 
 
 		 899 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.631713  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2872  HopL1 protein  26 
 
 		 899 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1314  virulence factor SrfC-like protein  22.33 
 
 		 878 aa  91.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3153  virulence factor protein  22.44 
 
 		 901 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.490604  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4053  hypothetical protein  25.66 
 
 		 890 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0957492  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0898  hypothetical protein  23.68 
 
 		 892 aa  76.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2282  virulence factor  26.67 
 
 		 185 aa  68.6  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1963  virulence factor SrfC-like protein  20.96 
 
 		 862 aa  61.2  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6480  hypothetical protein  23.14 
 
 		 938 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3217  virulence factor SrfC-like protein  21.8 
 
 		 835 aa  53.5  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.933423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>