37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1152 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1152  bacteriophage lysis protein  100 
 
 		 143 aa  294  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142023  hitchhiker  0.0000000000000115024 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2818  bacteriophage lysis protein  79.86 
 
 		 150 aa  209  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.570005  normal  0.122766 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2247  bacteriophage lysis protein  57.75 
 
 		 155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.727629  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0893  bacteriophage lysis protein  57.75 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0632  bacteriophage lysis protein  63.12 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000814148  normal  0.106962 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1138  bacteriophage lysis protein  56.94 
 
 		 164 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1532  bacteriophage lysis protein  56.64 
 
 		 155 aa  146  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1273  bacteriophage lysis protein  46.85 
 
 		 157 aa  120  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1614  bacteriophage lysis protein  45.14 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10031  cell lysis protein  45.14 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.025296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00729  hypothetical protein  45.14 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0229368  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1184  bacteriophage lysis protein  44.06 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00247125  hitchhiker  0.0000000000330558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1403  bacteriophage lysis protein  48.95 
 
 		 166 aa  116  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000130995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1066  bacteriophage lysis protein  48.95 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000488797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00508  predicted murein endopeptidase  43.75 
 
 		 153 aa  114  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3073  Phosphoprotein phosphatase  46.38 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00514  hypothetical protein  43.75 
 
 		 153 aa  114  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3207  bacteriophage lysis protein  44.76 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0122029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1859  bacteriophage lysis protein  44.76 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3523  bacteriophage lysis protein  42.36 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.328283  hitchhiker  0.000434351 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2608  bacteriophage lysis protein  42.66 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.048327  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1172  bacteriophage lysis protein  44.06 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.583234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2783  bacteriophage lysis protein  43.75 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0942  bacteriophage lysis protein  43.36 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2251  bacteriophage lysis protein  45.58 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000357179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3140  bacteriophage lysis protein  45.58 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000519306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1777  bacteriophage lysis protein  45.27 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.0335187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2899  bacteriophage lysis protein  41.96 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000634964 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0395  bacteriophage lysis protein  41.55 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328386  hitchhiker  0.00000000000000531683 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0828  bacteriophage lysis protein  41.26 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0305  bacteriophage lysis protein  42.65 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1451  bacteriophage lysis protein  43.56 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01348  hypothetical protein  44.9 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.512118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01338  predicted defective peptidase  44.9 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.604576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2181  bacteriophage lysis protein  32.19 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.225505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01976  hypothetical protein  40.66 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1135  lysis protein  30.28 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.308326  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>