22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0487 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0487  TOPRIM domain-containing protein  100 
 
 		 128 aa  263  8e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.721447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0836  TOPRIM domain-containing protein  80.47 
 
 		 129 aa  223  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00405243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0852  TOPRIM domain-containing protein  80.47 
 
 		 128 aa  223  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000918877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3585  TOPRIM domain-containing protein  50.5 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000963608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4812  TOPRIM domain-containing protein  50.5 
 
 		 114 aa  120  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000913447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5128  TOPRIM domain-containing protein  48.51 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4715  DNA primase  48.51 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000708612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4699  DNA primase  48.51 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00338236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5132  Toprim domain protein  48.51 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000167755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5133  Toprim domain protein  48.51 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0107  Toprim domain protein  48.51 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000016673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5096  Toprim domain protein  48.51 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5226  TOPRIM domain-containing protein  47.52 
 
 		 114 aa  117  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4858  TOPRIM domain-containing protein  47.52 
 
 		 114 aa  117  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3082  TOPRIM domain protein  47.75 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2949  TOPRIM domain protein  47.62 
 
 		 115 aa  104  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2931  TOPRIM domain protein  50 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000218405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0350  TOPRIM domain protein  36.89 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0073  primase/topoisomerase like protein  30.85 
 
 		 205 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000589128  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0184  primase homolog  38.36 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0130  primase-related protein  34.12 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.503861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2965  primase/topoisomerase like protein  28.92 
 
 		 192 aa  43.5  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000014203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>