29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0121 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0121  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  226  9e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0504  hypothetical protein  92.66 
 
 
109 aa  214  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0517  hypothetical protein  92.66 
 
 
109 aa  214  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0474282  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0122  protein of unknown function DUF970  62.39 
 
 
109 aa  150  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0604133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0034  protein of unknown function DUF970  53.7 
 
 
111 aa  131  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0373  hypothetical protein  53.21 
 
 
111 aa  127  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000275658 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0054  hypothetical protein  49.07 
 
 
109 aa  125  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.266654  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0280  hypothetical protein  49.54 
 
 
109 aa  120  8e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0513  protein of unknown function DUF970  49.07 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0331  hypothetical protein  53.57 
 
 
107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0157  protein of unknown function DUF970  44.44 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1406  hypothetical protein  49.54 
 
 
108 aa  110  9e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.38193  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2374  protein of unknown function DUF970  47.22 
 
 
109 aa  107  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2941  protein of unknown function DUF970  45.54 
 
 
108 aa  106  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.203719 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1670  hypothetical protein  46.23 
 
 
109 aa  104  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0682  protein of unknown function DUF970  46.73 
 
 
109 aa  104  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3719  hypothetical protein  46.53 
 
 
115 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3231  hypothetical protein  46.53 
 
 
112 aa  101  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1127  protein of unknown function DUF970  44.95 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000158497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2445  hypothetical protein  49.06 
 
 
109 aa  94.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.758791  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2760  hypothetical protein  49.06 
 
 
109 aa  93.6  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1349  hypothetical protein  39.82 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20370  hypothetical protein  41.56 
 
 
80 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0788  protein of unknown function DUF970  33.33 
 
 
108 aa  84  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2607  protein of unknown function DUF970  35.19 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000153353  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2960  protein of unknown function DUF970  46.88 
 
 
80 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000522235 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1048  protein of unknown function DUF970  29.13 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3470  hypothetical protein  45.31 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136027  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1490  hypothetical protein  46.67 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302129  normal  0.540685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>