16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2017 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG2017  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 429 aa  879    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.744887  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0932  Tn916, transcriptional regulator, putative  28.61 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1044  transcriptional regulator  23.28 
 
 		 542 aa  73.2  0.000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.547472  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1756  replication initiation factor  20.6 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008500  STER_A3  transcriptional regulator  23.64 
 
 		 368 aa  50.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2833  hypothetical protein  47.73 
 
 		 96 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1988  hypothetical protein  22.43 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31960  transcriptional regulator protein  47.73 
 
 		 95 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2114  hypothetical protein  23.36 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00301162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0269  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 99 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.506568  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1566  replication initiation factor  28.68 
 
 		 340 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1577  replication initiation factor  28.68 
 
 		 340 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1588  replication initiation factor  28.68 
 
 		 340 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2738  XRE family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 95 aa  43.9  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4938  XRE family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 95 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0484665  hitchhiker  0.0000000184601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1198  Cro/CI family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 98 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>