28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2001 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2001  conjugal transfer protein, interruption-C  100 
 
 
756 aa  1562    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1037  conjugal transfer protein, ATPase  28.57 
 
 
832 aa  285  3.0000000000000004e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0140  AAA ATPase  24.07 
 
 
823 aa  138  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272915  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0477  ATPase  22.01 
 
 
827 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3057  AAA ATPase  22.18 
 
 
816 aa  128  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8472  hypothetical protein  22.96 
 
 
830 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547779  normal  0.957952 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1100  AAA ATPase  24.17 
 
 
821 aa  124  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0231  hypothetical protein  21.58 
 
 
846 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1445  hypothetical protein  22.08 
 
 
819 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.218302  normal  0.184359 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0044  hypothetical protein  24.23 
 
 
856 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0794  hypothetical protein  27.54 
 
 
805 aa  62.4  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2508  hypothetical protein  22.19 
 
 
792 aa  62.4  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0860063 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0575  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.1 
 
 
802 aa  60.1  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3115  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.61 
 
 
802 aa  55.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.19 
 
 
850 aa  50.8  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0308  hypothetical protein  21.43 
 
 
807 aa  48.1  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.287416  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0439  FtsK/SpoIIIE family protein  35.21 
 
 
814 aa  47  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.549102  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1167  hypothetical protein  25.14 
 
 
826 aa  47.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_381  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE, S-DNA-T family  35.21 
 
 
814 aa  47  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0416  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.21 
 
 
816 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.538525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1667  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.37 
 
 
830 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0378657 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1420  cell division FtsK/SpoIIIE  40.32 
 
 
776 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.538178  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0279  DNA segregation ATPase  38.36 
 
 
969 aa  45.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1072  cell division FtsK/SpoIIIE  39.53 
 
 
774 aa  44.7  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.272845 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0793  ATPase  35.14 
 
 
833 aa  44.3  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.948463  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0336  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.48 
 
 
801 aa  44.3  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1024  FtsK/SpoIIIE family protein  26.62 
 
 
899 aa  44.3  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0371  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.94 
 
 
910 aa  43.9  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.165249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>