34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1788 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1788  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  100 
 
 
79 aa  157  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0804  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  81.01 
 
 
79 aa  131  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.764285  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1815  D-alanyl carrier protein  51.32 
 
 
78 aa  88.2  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0475317  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1816  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  47.44 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233784  hitchhiker  0.0000200669 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0287  D-alanyl transfer protein  43.42 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.14826  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1372  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  48.72 
 
 
79 aa  65.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.896252  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0250  D-alanyl carrier protein  37.97 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.22726  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0443  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  36.84 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1485  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  32.89 
 
 
79 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1292  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  32.89 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.133967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1528  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  32.89 
 
 
79 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1422  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  32.89 
 
 
79 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3922  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  32.89 
 
 
79 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.864811  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1387  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  32.89 
 
 
79 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1459  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  32.89 
 
 
79 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1259  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  32.89 
 
 
79 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1257  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  32.89 
 
 
79 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1285  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  32.89 
 
 
79 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1090  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  32.89 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0953  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  33.77 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.798943  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0934  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  33.77 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.506385  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0520  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  32.47 
 
 
78 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1791  D-alanyl carrier protein  44.64 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.401624  normal  0.920733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0819  acyl carrier protein  33.33 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0656  acyl carrier protein  33.75 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0642  acyl carrier protein  33.75 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2511  acyl carrier protein  33.75 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.161811  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2196  acyl carrier protein  33.75 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2889  acyl carrier protein  33.75 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0043  acyl carrier protein  33.75 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0167  D-alanyl carrier protein  39.66 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.021153  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2525  acyl carrier protein  39.29 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.443758  normal  0.0225016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0532  acyl carrier protein  32.5 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1719  acyl carrier protein  39.29 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>