45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2779 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  678    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  46.76 
 
 
337 aa  242  7.999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  44.44 
 
 
348 aa  222  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  37.86 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  41.52 
 
 
340 aa  218  8.999999999999998e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  38.28 
 
 
343 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  43.06 
 
 
363 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  37.98 
 
 
343 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  42.86 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  40.12 
 
 
349 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  36.55 
 
 
337 aa  209  8e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  39.24 
 
 
348 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  41.6 
 
 
360 aa  206  4e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  38.22 
 
 
365 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  42.05 
 
 
337 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  40 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  40.64 
 
 
332 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  40.68 
 
 
340 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  34.35 
 
 
359 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  39.69 
 
 
340 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  39.22 
 
 
331 aa  180  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  39.79 
 
 
333 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  39.44 
 
 
333 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  39.64 
 
 
329 aa  176  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  39.44 
 
 
333 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  35.29 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  44.24 
 
 
340 aa  173  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  38.69 
 
 
330 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  38.38 
 
 
333 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  35 
 
 
338 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  36.96 
 
 
335 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  36.49 
 
 
333 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  38.85 
 
 
335 aa  165  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  40.6 
 
 
348 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  40.43 
 
 
336 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  37.45 
 
 
333 aa  162  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  34.51 
 
 
340 aa  162  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  39.72 
 
 
336 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  39.72 
 
 
336 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  35.92 
 
 
334 aa  159  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  34.29 
 
 
392 aa  152  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  38.8 
 
 
335 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  32.36 
 
 
353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  31.02 
 
 
354 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  35.4 
 
 
371 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>