15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0218 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0218  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  585  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1660  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.31 
 
 
320 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2152  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.55 
 
 
326 aa  192  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37570  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  45.7 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295733  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0168  hypothetical protein  33.75 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.01 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000436445  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0640  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.3 
 
 
301 aa  101  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.49 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 
307 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3821  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.72 
 
 
150 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  26.43 
 
 
293 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  27.82 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  32.38 
 
 
337 aa  42.7  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>