17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4174 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4174  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 727 aa  1408    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0332  cellulose synthase  34.42 
 
 		 725 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1977  putative cellulose synthase  34.21 
 
 		 725 aa  295  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.94511  normal  0.202937 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0963  hypothetical protein  34.98 
 
 		 721 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355917 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5534  celB protein  24.5 
 
 		 758 aa  89  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1205  cellulose synthase subunit B  25.06 
 
 		 817 aa  82  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1313  hypothetical protein  27.46 
 
 		 875 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1294  cellulose synthase subunit B  25.6 
 
 		 813 aa  75.5  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0106  hypothetical protein  28.15 
 
 		 858 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00890818  normal  0.867993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1368  hypothetical protein  33.33 
 
 		 881 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0776152  normal  0.0920339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1568  cellulose synthase subunit B  33.33 
 
 		 880 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3740  cellulose synthase subunit B  28.12 
 
 		 842 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4804  cellulose synthase subunit B  25.5 
 
 		 843 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.328692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4798  hypothetical protein  30.65 
 
 		 766 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0274  hypothetical protein  28.64 
 
 		 862 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.237826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00788  celB protein  25.76 
 
 		 758 aa  48.9  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5209  cellulose synthase subunit B  28.75 
 
 		 773 aa  47.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>