256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3757 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3757  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0794  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  88.56 
 
 
335 aa  564  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3861  sulfate/molybdate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  84.19 
 
 
334 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.830812  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4179  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  83.55 
 
 
334 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354274  normal  0.159883 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4087  hypothetical protein  86.51 
 
 
289 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0732024 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4344  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  77.95 
 
 
328 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0989658  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6755  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  64.81 
 
 
341 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5843  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  64.81 
 
 
341 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.302205  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  67.2 
 
 
807 aa  431  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0120  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  66.77 
 
 
342 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2077  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  65.03 
 
 
341 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000402733  hitchhiker  0.00000000000000351214 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4544  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  67.65 
 
 
341 aa  418  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0107  sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  65.22 
 
 
342 aa  420  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  66.13 
 
 
798 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5393  ABC transporter substrate binding protein (sulfate)  65.34 
 
 
338 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0845321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0628  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  65.03 
 
 
335 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3400  thiosulphate-binding protein  65.71 
 
 
354 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0940818  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4410  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  66.14 
 
 
342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02518  ABC transporter sulfate binding protein  61.47 
 
 
365 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.607163  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  62.39 
 
 
331 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1572  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  64.87 
 
 
344 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.61 
 
 
337 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.55 
 
 
356 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  64.5 
 
 
337 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.82 
 
 
337 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31720  Sulfate-binding precursor protein  65.15 
 
 
332 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5896  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.95 
 
 
341 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183484  normal  0.734335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4345  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.43 
 
 
332 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.23 
 
 
337 aa  391  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0618  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.15 
 
 
339 aa  391  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0236749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  62.96 
 
 
329 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03700  sulfate-binding protein precursor  61.95 
 
 
332 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2422  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.86 
 
 
343 aa  391  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0698  ABC transporter sulfate binding protein  60.83 
 
 
339 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  64.74 
 
 
335 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0374  sulfate-binding protein precursor  62.86 
 
 
332 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.87 
 
 
337 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.64 
 
 
329 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1045  thiosulphate-binding protein  61.73 
 
 
327 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0821  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.73 
 
 
329 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0561556  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.61 
 
 
359 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0194  thiosulphate-binding protein  61.4 
 
 
337 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648325  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  61.69 
 
 
330 aa  384  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4641  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.66 
 
 
340 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.869357  hitchhiker  0.00000640821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0967  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.19 
 
 
337 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.56 
 
 
337 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.41 
 
 
339 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.74 
 
 
339 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2246  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.55 
 
 
349 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2981  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.63 
 
 
345 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0620  thiosulphate-binding protein  58.97 
 
 
336 aa  381  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000295034  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1156  thiosulphate-binding protein  60.19 
 
 
329 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  61.89 
 
 
329 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  62.88 
 
 
335 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3315  hypothetical protein  63.07 
 
 
328 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227914  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0122  thiosulfate binding protein  64.19 
 
 
337 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964738  decreased coverage  0.00000712106 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  61.41 
 
 
336 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0084  extracellular solute-binding protein  60.49 
 
 
336 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  59.87 
 
 
346 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5078  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.67 
 
 
335 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151813  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5231  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.98 
 
 
335 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297946  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0581  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.53 
 
 
355 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.105531  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2061  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.63 
 
 
331 aa  375  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0556  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.68 
 
 
349 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0592  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.53 
 
 
355 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.347338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0291  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.67 
 
 
335 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  60.31 
 
 
329 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5171  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.06 
 
 
342 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138843  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4554  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.58 
 
 
350 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.75 
 
 
341 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2345  thiosulphate-binding protein  59.82 
 
 
342 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6842  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1394  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.43 
 
 
338 aa  371  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0563  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.13 
 
 
341 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201199  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0899  sulfate starvation-induced protein 2  58.73 
 
 
338 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0308  sulfate-binding protein  58.61 
 
 
338 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1578  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.19 
 
 
345 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1923  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.7 
 
 
339 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.436654  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1781  thiosulphate-binding protein  61.17 
 
 
344 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1121  thiosulphate-binding protein  60.19 
 
 
345 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1601  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.19 
 
 
345 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3046  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.94 
 
 
341 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.398245  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2196  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.42 
 
 
345 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.559252  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1799  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.7 
 
 
356 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.689523  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  58.49 
 
 
329 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.49 
 
 
329 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1011  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.76 
 
 
351 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  58.49 
 
 
329 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2760  thiosulphate-binding protein  60.98 
 
 
329 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1861  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60 
 
 
345 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  58.49 
 
 
329 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2013  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60 
 
 
345 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1552  thiosulphate-binding protein  56.97 
 
 
335 aa  364  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  58.49 
 
 
329 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  60.66 
 
 
329 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  58.49 
 
 
329 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1847  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60 
 
 
345 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1698  sulfate/thiosulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  60 
 
 
345 aa  364  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0701208  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  58.49 
 
 
329 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1223  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.06 
 
 
358 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1125  sulfate-binding protein  58.63 
 
 
351 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>