17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0963 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1977  putative cellulose synthase  69.56 
 
 		 725 aa  892    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.94511  normal  0.202937 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0963  hypothetical protein  100 
 
 		 721 aa  1394    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0332  cellulose synthase  68.61 
 
 		 725 aa  898    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4174  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 		 727 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4798  hypothetical protein  28.99 
 
 		 766 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3740  cellulose synthase subunit B  29.49 
 
 		 842 aa  109  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1568  cellulose synthase subunit B  29.45 
 
 		 880 aa  100  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1368  hypothetical protein  29.12 
 
 		 881 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0776152  normal  0.0920339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1313  hypothetical protein  28.18 
 
 		 875 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0274  hypothetical protein  26.39 
 
 		 862 aa  90.5  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.237826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4804  cellulose synthase subunit B  26.34 
 
 		 843 aa  87.8  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.328692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1205  cellulose synthase subunit B  34.11 
 
 		 817 aa  60.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1294  cellulose synthase subunit B  32.87 
 
 		 813 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5534  celB protein  28.93 
 
 		 758 aa  58.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00788  celB protein  24.14 
 
 		 758 aa  55.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5209  cellulose synthase subunit B  27.85 
 
 		 773 aa  55.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0106  hypothetical protein  32.14 
 
 		 858 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00890818  normal  0.867993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>