240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2904 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2904  transposase  100 
 
 
135 aa  274  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  83.72 
 
 
399 aa  224  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  83.72 
 
 
399 aa  224  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  80 
 
 
399 aa  222  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  81.48 
 
 
399 aa  221  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  81.48 
 
 
399 aa  221  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  81.48 
 
 
399 aa  221  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  81.48 
 
 
399 aa  221  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  81.48 
 
 
399 aa  221  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  80.62 
 
 
399 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  80.62 
 
 
399 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6345  transposase mutator type  81.06 
 
 
185 aa  220  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442764  normal  0.442259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  82.95 
 
 
266 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5006  transposase mutator type  80.62 
 
 
337 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2516  transposase mutator type  78.74 
 
 
147 aa  202  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  71.77 
 
 
398 aa  186  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  70.97 
 
 
398 aa  182  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  70.97 
 
 
398 aa  182  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  70.97 
 
 
398 aa  182  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  70.97 
 
 
398 aa  182  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  67.74 
 
 
398 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  56.3 
 
 
403 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1531  transposase mutator type  56.3 
 
 
405 aa  147  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0112  transposase mutator type  56.3 
 
 
405 aa  147  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1511  transposase mutator type  56.3 
 
 
405 aa  147  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.647595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1904  transposase mutator type  56.3 
 
 
405 aa  147  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3132  transposase mutator type  56.3 
 
 
405 aa  147  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1513  transposase mutator type  56.3 
 
 
405 aa  147  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.688883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1539  transposase mutator type  56.3 
 
 
405 aa  147  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  55.04 
 
 
402 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  55.04 
 
 
402 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  55.04 
 
 
402 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4171  transposase mutator type  55.47 
 
 
384 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  53.73 
 
 
402 aa  143  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  53.73 
 
 
402 aa  143  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  53.73 
 
 
402 aa  143  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  53.73 
 
 
402 aa  143  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  53.73 
 
 
402 aa  143  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  53.73 
 
 
402 aa  143  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  53.73 
 
 
402 aa  143  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  53.73 
 
 
402 aa  143  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  53.73 
 
 
402 aa  143  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  53.73 
 
 
402 aa  143  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  53.73 
 
 
402 aa  143  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  53.73 
 
 
402 aa  143  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  53.73 
 
 
402 aa  143  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  53.73 
 
 
402 aa  143  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  53.73 
 
 
402 aa  143  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  55.04 
 
 
402 aa  140  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  55.04 
 
 
402 aa  140  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  55.04 
 
 
402 aa  140  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  55.04 
 
 
402 aa  140  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  55.04 
 
 
402 aa  140  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  54.26 
 
 
402 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13671  transposase  57.98 
 
 
409 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.967269  normal  0.0391652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0630  transposase, mutator type  52.63 
 
 
361 aa  130  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1234  transposase mutator type  50.76 
 
 
415 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.199668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1182  transposase mutator type  50.76 
 
 
415 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2883  transposase mutator type  50.76 
 
 
414 aa  123  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000527688  hitchhiker  0.001163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0688  transposase, mutator type  50.82 
 
 
411 aa  123  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0889  transposase, mutator type  50.82 
 
 
428 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2876  transposase, mutator type  50.82 
 
 
428 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0700  transposase, mutator type  50.82 
 
 
428 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0454  transposase, mutator type  50 
 
 
353 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5496  transposase, mutator type  50 
 
 
353 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0512335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3590  transposase, mutator type  50 
 
 
370 aa  121  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0292  transposase, mutator type  52.03 
 
 
406 aa  120  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0587  transposase, mutator type  52.03 
 
 
406 aa  120  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0594  transposase, mutator type  52.03 
 
 
406 aa  120  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1889  transposase, mutator type  52.03 
 
 
406 aa  120  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2017  transposase, mutator type  52.03 
 
 
406 aa  120  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2201  transposase, mutator type  52.03 
 
 
406 aa  120  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2672  transposase, mutator type  52.03 
 
 
406 aa  121  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2816  transposase, mutator type  52.03 
 
 
406 aa  120  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2958  transposase, mutator type  52.03 
 
 
406 aa  121  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5356  transposase, mutator type  49.18 
 
 
428 aa  120  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116782  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  53.04 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  53.04 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  53.04 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3032  transposase mutator type  51.72 
 
 
413 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4611  transposase mutator type  51.72 
 
 
413 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310217  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  55.96 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  55.96 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  55.96 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  55.96 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3191  transposase, mutator type  48.48 
 
 
411 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0678  transposase, mutator type  48.48 
 
 
411 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1368  transposase mutator type  51.72 
 
 
540 aa  117  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13468  transposase  52.5 
 
 
281 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0327912  hitchhiker  0.000514012 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10440  Transposase, Mutator family  48.78 
 
 
422 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000572407  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5755  transposase, mutator type  46.76 
 
 
411 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431676  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10460  Transposase, Mutator family  48.78 
 
 
422 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000746086  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5359  transposase, mutator type  46.76 
 
 
411 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502156  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5576  transposase, mutator type  48.48 
 
 
400 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5979  transposase, mutator type  48.48 
 
 
391 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.640572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  50.85 
 
 
419 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  50.85 
 
 
419 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  50.85 
 
 
419 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12080  transposase, mutator family  44.26 
 
 
417 aa  111  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0258594  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12170  transposase, mutator family  44.26 
 
 
417 aa  111  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>