17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2260 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2260  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3877  hypothetical protein  42.39 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.65728  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1437  hypothetical protein  35.87 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1246  hypothetical protein  34.74 
 
 		 201 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.96129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2209  hypothetical protein  34.09 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6050  hypothetical protein  31.96 
 
 		 274 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0160776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1046  hypothetical protein  31.96 
 
 		 274 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0293448  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3870  hypothetical protein  32.63 
 
 		 193 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4600  hypothetical protein  32.18 
 
 		 226 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7552  hypothetical protein  27.64 
 
 		 173 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0606564  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2074  hypothetical protein  30.66 
 
 		 182 aa  45.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198993  normal  0.263548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4233  hypothetical protein  28.45 
 
 		 220 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1590  hypothetical protein  27.36 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4180  hypothetical protein  36.23 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5620  nutrient deprivation-induced protein  26.13 
 
 		 189 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.188949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1484  hypothetical protein  26.79 
 
 		 181 aa  40.8  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000292957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>