52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1628 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1628  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  152  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2170  hypothetical protein  57.63 
 
 		 73 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.171607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1203  hypothetical protein  47.46 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1551  hypothetical protein  45.31 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000076814  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1470  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1043  hypothetical protein  40.3 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0114324  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1635  hypothetical protein  55.56 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1374  hypothetical protein  47.92 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.942337  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1086  hypothetical protein  43.14 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1118  hypothetical protein  38.98 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000000356616  normal  0.666231 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1480  hypothetical protein  57.45 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0208  hypothetical protein  52.17 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2546  hypothetical protein  55.81 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548199  normal  0.019769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2167  hypothetical protein  45.28 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1848  hypothetical protein  48.15 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2111  hypothetical protein  57.5 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0332629  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2188  hypothetical protein  49.09 
 
 		 72 aa  52  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1913  hypothetical protein  57.5 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2699  hypothetical protein  47.92 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35280  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6080  putative lipoprotein  39.68 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70060  putative lipoprotein  39.68 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4480  hypothetical protein  42.19 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.623363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2435  hypothetical protein  57.89 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1923  hypothetical protein  57.89 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00521394  normal  0.086413 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2428  hypothetical protein  57.89 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0366345  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1844  hypothetical protein  55.26 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0660907  normal  0.43293 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1790  hypothetical protein  55.26 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2187  hypothetical protein  55.26 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0102692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2063  hypothetical protein  56.76 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1944  putative outer membrane lipoprotein  35.09 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0480878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1762  hypothetical protein  35.59 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.662266  normal  0.131385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1694  hypothetical protein  35.59 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040023 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1511  hypothetical protein  35.59 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1916  putative outer membrane lipoprotein  38.78 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1825  hypothetical protein  35.59 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.9314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1765  hypothetical protein  35.59 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0522484 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1567  putative lipoprotein  37.93 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2598  hypothetical protein  32.2 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4965  hypothetical protein  43.55 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1620  putative lipoprotein  36.21 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3337  hypothetical protein  34.78 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0619  hypothetical protein  33.33 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2004  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01367  hypothetical protein  34.48 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01354  predicted lipoprotein  34.48 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1769  putative lipoprotein  34.48 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.443253 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2273  hypothetical protein  34.48 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1469  putative lipoprotein  34.48 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1073  hypothetical protein  43.14 
 
 		 48 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.648957  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2263  conserved hypothetical protein  34.48 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00468186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>