60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2170 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2170  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  145  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.171607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1043  hypothetical protein  64.91 
 
 		 67 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0114324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1913  hypothetical protein  59.38 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1203  hypothetical protein  59.68 
 
 		 66 aa  77  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1551  hypothetical protein  56.9 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000076814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1635  hypothetical protein  56.92 
 
 		 66 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1118  hypothetical protein  61.4 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000000356616  normal  0.666231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1628  hypothetical protein  57.63 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1086  hypothetical protein  57.38 
 
 		 68 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2699  hypothetical protein  60 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2188  hypothetical protein  60.66 
 
 		 72 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2167  hypothetical protein  58.93 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2546  hypothetical protein  60.66 
 
 		 72 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548199  normal  0.019769 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1470  hypothetical protein  44.44 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1374  hypothetical protein  63.27 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.942337  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1694  hypothetical protein  48.28 
 
 		 63 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040023 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1762  hypothetical protein  48.28 
 
 		 63 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.662266  normal  0.131385 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1825  hypothetical protein  48.28 
 
 		 63 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.9314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1480  hypothetical protein  60.34 
 
 		 62 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1765  hypothetical protein  48.28 
 
 		 63 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0522484 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1511  hypothetical protein  48.28 
 
 		 63 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1567  putative lipoprotein  50.88 
 
 		 61 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1848  hypothetical protein  57.38 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2111  hypothetical protein  65.31 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0332629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1620  putative lipoprotein  49.12 
 
 		 61 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1944  putative outer membrane lipoprotein  52.54 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0480878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0208  hypothetical protein  65.22 
 
 		 62 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2004  putative lipoprotein  49.09 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1769  putative lipoprotein  47.37 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.443253 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2273  hypothetical protein  47.37 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01367  hypothetical protein  47.37 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2263  conserved hypothetical protein  47.37 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00468186  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1469  putative lipoprotein  47.37 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01354  predicted lipoprotein  47.37 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2598  hypothetical protein  47.37 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2435  hypothetical protein  69.57 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2428  hypothetical protein  69.57 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0366345  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1923  hypothetical protein  69.57 
 
 		 72 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00521394  normal  0.086413 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1844  hypothetical protein  50.77 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0660907  normal  0.43293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6080  putative lipoprotein  50.82 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35280  hypothetical protein  54.9 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70060  putative lipoprotein  50.82 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4480  hypothetical protein  48.39 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.623363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2187  hypothetical protein  67.39 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0102692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1790  hypothetical protein  67.39 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2063  hypothetical protein  68.89 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1916  putative outer membrane lipoprotein  46.55 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3337  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2137  hypothetical protein  50 
 
 		 57 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2214  putative lipoprotein  40.68 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0619  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1810  putative lipoprotein  40.68 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1920  putative lipoprotein  40.68 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.495978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2290  putative lipoprotein  40.35 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0394311  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2590  putative lipoprotein  41.18 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1073  hypothetical protein  52.08 
 
 		 48 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.648957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1313  hypothetical protein  46.34 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.626247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4965  hypothetical protein  42.11 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1781  hypothetical protein  37.78 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4713  putative lipoprotein  51.22 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>