36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4480 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4480  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.623363 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1073  hypothetical protein  62.22 
 
 		 48 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.648957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2170  hypothetical protein  48.39 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.171607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1313  hypothetical protein  63.64 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.626247  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2214  putative lipoprotein  46.94 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2004  putative lipoprotein  41.51 
 
 		 61 aa  52  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1810  putative lipoprotein  46.94 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1920  putative lipoprotein  46.94 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.495978  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1628  hypothetical protein  42.19 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1825  hypothetical protein  34.78 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.9314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2273  hypothetical protein  37.04 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1769  putative lipoprotein  37.04 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.443253 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1762  hypothetical protein  34.78 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.662266  normal  0.131385 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1567  putative lipoprotein  37.04 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1765  hypothetical protein  34.78 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0522484 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1511  hypothetical protein  34.78 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1694  hypothetical protein  34.78 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040023 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01367  hypothetical protein  37.04 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2263  conserved hypothetical protein  37.04 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00468186  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1469  putative lipoprotein  37.04 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01354  predicted lipoprotein  37.04 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1118  hypothetical protein  35.59 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000000356616  normal  0.666231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1944  putative outer membrane lipoprotein  38.33 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0480878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1620  putative lipoprotein  35.19 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35280  hypothetical protein  47.06 
 
 		 63 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1551  hypothetical protein  36.07 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000076814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1913  hypothetical protein  36.62 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1470  hypothetical protein  35.29 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2167  hypothetical protein  38.03 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2598  hypothetical protein  36.67 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2699  hypothetical protein  42 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0208  hypothetical protein  43.48 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1043  hypothetical protein  37.04 
 
 		 67 aa  44.3  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0114324  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1635  hypothetical protein  35 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70060  putative lipoprotein  38.18 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6080  putative lipoprotein  38.18 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>