57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2137 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2137  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0619  hypothetical protein  64.58 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4713  putative lipoprotein  65.31 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1043  hypothetical protein  57.41 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0114324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1913  hypothetical protein  59.26 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2167  hypothetical protein  57.41 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1916  putative outer membrane lipoprotein  57.41 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2699  hypothetical protein  57.41 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1203  hypothetical protein  57.89 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1480  hypothetical protein  59.26 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2546  hypothetical protein  60.42 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548199  normal  0.019769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1635  hypothetical protein  58.18 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1848  hypothetical protein  53.45 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2598  hypothetical protein  56.25 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1567  putative lipoprotein  50.82 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1944  putative outer membrane lipoprotein  54.17 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0480878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3337  hypothetical protein  58.7 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1551  hypothetical protein  52.08 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000076814  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2170  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.171607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1620  putative lipoprotein  49.18 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1086  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2188  hypothetical protein  54 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70060  putative lipoprotein  56.52 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6080  putative lipoprotein  56.52 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1118  hypothetical protein  49.12 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000000356616  normal  0.666231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2263  conserved hypothetical protein  49.18 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00468186  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2273  hypothetical protein  49.18 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1769  putative lipoprotein  49.18 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.443253 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1923  hypothetical protein  59.09 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00521394  normal  0.086413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01367  hypothetical protein  49.18 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01354  predicted lipoprotein  49.18 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2428  hypothetical protein  60.47 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0366345  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1469  putative lipoprotein  49.18 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2435  hypothetical protein  60.47 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2004  putative lipoprotein  54.17 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2111  hypothetical protein  57.78 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0332629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35280  hypothetical protein  55.32 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1374  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.942337  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1810  putative lipoprotein  50 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1694  hypothetical protein  52.17 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040023 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1511  hypothetical protein  52.17 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1765  hypothetical protein  52.17 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0522484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1825  hypothetical protein  52.17 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.9314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1762  hypothetical protein  52.17 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.662266  normal  0.131385 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1790  hypothetical protein  56.82 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2187  hypothetical protein  56.82 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0102692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1844  hypothetical protein  56.82 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0660907  normal  0.43293 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1920  putative lipoprotein  50 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.495978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2214  putative lipoprotein  50 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2063  hypothetical protein  59.52 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0208  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1470  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2290  putative lipoprotein  51.06 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0394311  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2590  putative lipoprotein  48.94 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2385  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000182752  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1781  hypothetical protein  48.78 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1628  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>