25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1073 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1073  hypothetical protein  100 
 
 		 48 aa  99.4  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.648957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4480  hypothetical protein  62.22 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.623363 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1313  hypothetical protein  61.36 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.626247  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2170  hypothetical protein  52.08 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.171607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1810  putative lipoprotein  42.55 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1920  putative lipoprotein  42.55 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.495978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2214  putative lipoprotein  42.55 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0208  hypothetical protein  43.48 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1470  hypothetical protein  43.9 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1628  hypothetical protein  43.14 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1469  putative lipoprotein  35.42 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01367  hypothetical protein  35.42 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1769  putative lipoprotein  35.42 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.443253 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2273  hypothetical protein  35.42 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1567  putative lipoprotein  35.42 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01354  predicted lipoprotein  35.42 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1043  hypothetical protein  42 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0114324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2263  conserved hypothetical protein  35.42 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00468186  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2699  hypothetical protein  45.83 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1944  putative outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0480878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1620  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 61 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2188  hypothetical protein  43.18 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35280  hypothetical protein  42.55 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1203  hypothetical protein  37.25 
 
 		 66 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2004  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 61 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>