87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2147 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2147  protein of unknown function DUF339  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1823  protein of unknown function DUF339  98.95 
 
 		 95 aa  189  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0813209  normal  0.601393 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1992  hypothetical protein  88.42 
 
 		 95 aa  143  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10824  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2321  hypothetical protein  76.84 
 
 		 95 aa  120  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2482  hypothetical protein  80 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3831  hypothetical protein  75.58 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.539928 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3315  hypothetical protein  75.58 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83082  normal  0.599148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2148  hypothetical protein  75.58 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3590  hypothetical protein  74.42 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.068021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3938  hypothetical protein  74.42 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4644  hypothetical protein  73.26 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4429  hypothetical protein  74.42 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.731953  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0789  TPR repeat-containing protein  73.26 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0308696  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0664  TPR repeat-containing protein  73.26 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292357  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2330  TPR repeat-containing protein  73.26 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2468  TPR repeat-containing protein  73.26 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113505  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0503  TPR repeat-containing protein  72.09 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245858  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1625  hypothetical protein  72.09 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0433858  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1833  hypothetical protein  72.09 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0385386  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2891  hypothetical protein  73.26 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1745  hypothetical protein  72.09 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565247  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6852  protein of unknown function DUF339  72.09 
 
 		 90 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.493884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4365  hypothetical protein  71.76 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5590  hypothetical protein  70.59 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.678134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2423  hypothetical protein  53.09 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1059  protein of unknown function DUF339  53.85 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.621454  normal  0.0453612 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0762  hypothetical protein  52.56 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1797  hypothetical protein  42.22 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.908187  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2702  hypothetical protein  55 
 
 		 91 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00765809 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2166  hypothetical protein  51.85 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2200  hypothetical protein  50.67 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.521677  normal  0.894943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1426  protein of unknown function DUF339  46.05 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3036  hypothetical protein  50.65 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2287  protein of unknown function DUF339  48.15 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2797  hypothetical protein  48.15 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  36.36 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3604  hypothetical protein  54.29 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1876  protein of unknown function DUF339  37.5 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  34.44 
 
 		 103 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2254  response regulator receiver domain-containing protein  31.51 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00897791  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3430  hypothetical protein  32.1 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0859  hypothetical protein  37.14 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  32.84 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1336  hypothetical protein  39.06 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.401477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1045  hypothetical protein  36.67 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.453082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3035  hypothetical protein  38.1 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.380295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1192  hypothetical protein  34.92 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  38.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  38.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1269  hypothetical protein  34.92 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  38.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1236  hypothetical protein  34.92 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3121  protein of unknown function DUF339  34.92 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0704763 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  32.84 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2265  hypothetical protein  30.14 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2861  hypothetical protein  45.61 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3305  hypothetical protein  30.77 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002489  hypothetical protein  31.75 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.864152  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3317  hypothetical protein  36.51 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02692  hypothetical protein  36.51 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.213923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0795  protein of unknown function DUF339  36.51 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4188  hypothetical protein  36.51 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0812  hypothetical protein  36.51 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.463653  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02729  hypothetical protein  36.51 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3315  hypothetical protein  39.68 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1150  hypothetical protein  36.51 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225025  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3223  hypothetical protein  36.51 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3030  hypothetical protein  36.51 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1139  hypothetical protein  34.78 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3282  hypothetical protein  34.92 
 
 		 88 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0638  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1186  hypothetical protein  36.07 
 
 		 104 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.990157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2857  hypothetical protein  36.51 
 
 		 79 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2939  hypothetical protein  36.51 
 
 		 79 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.427354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54470  hypothetical protein  33.85 
 
 		 84 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234061  normal  0.929055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.736883  normal  0.107971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4760  hypothetical protein  33.85 
 
 		 84 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3384  hypothetical protein  34.92 
 
 		 88 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3204  hypothetical protein  34.92 
 
 		 88 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3216  hypothetical protein  34.92 
 
 		 88 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3279  hypothetical protein  34.92 
 
 		 88 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3898  hypothetical protein  32.1 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.929293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  32.14 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1464  hypothetical protein  36.21 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00913316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1339  hypothetical protein  33.93 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0852  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>