43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0745 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0798  putative purine nucleoside permease protein  90.3 
 
 
381 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0815  purine nucleoside permease  98.65 
 
 
371 aa  748    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0745  purine nucleoside permease  100 
 
 
371 aa  758    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.64688  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4629  purine nucleoside permease  62.73 
 
 
355 aa  428  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00101608  normal  0.109746 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5237  purine nucleoside permease  58.43 
 
 
359 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4914  purine nucleoside permease  60.13 
 
 
359 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.78554  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3369  purine nucleoside permease  60.44 
 
 
357 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3010  purine nucleoside permease  60.13 
 
 
359 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435563  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5356  purine nucleoside permease  60.13 
 
 
359 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4706  purine nucleoside permease  58.43 
 
 
359 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0697594  normal  0.247967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0289  purine nucleoside transporter  59.18 
 
 
359 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.859349  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0822  putative lipoprotein  60.44 
 
 
353 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0409  purine nucleoside permease family protein  60.44 
 
 
353 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0507  purine nucleoside permease family protein  60.44 
 
 
335 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2138  putative lipoprotein  60.44 
 
 
353 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2112  putative lipoprotein  60.44 
 
 
353 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1471  putative lipoprotein  60.44 
 
 
353 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1835  putative lipoprotein  60.44 
 
 
335 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0845  CNT family concentrative nucleoside/H+ anitporter  58.54 
 
 
358 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673784  normal  0.0511609 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4530  purine nucleoside permease  59.49 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0746  purine nucleoside permease  59.62 
 
 
349 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119389  normal  0.778761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0816  purine nucleoside permease  58.97 
 
 
349 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0799  putative purine nucleoside permease protein  58.65 
 
 
346 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4123  purine nucleoside permease, putative  56.47 
 
 
343 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3859  purine nucleoside permease  56.18 
 
 
343 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3758  purine nucleoside permease  58.06 
 
 
340 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1496  putative purine nucleoside permease  49.84 
 
 
370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1619  purine nucleoside permease  49.51 
 
 
345 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1872  Purine nucleoside permease protein  48.69 
 
 
364 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10683  purine nucleoside permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00810)  44.38 
 
 
396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139964  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76929  purine nucleoside permease  41.9 
 
 
406 aa  244  9.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.638652 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31020  purine nucleoside permease  40.95 
 
 
402 aa  239  5.999999999999999e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171142  normal  0.23144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3260  purine nucleoside permease  38.11 
 
 
356 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1232  purine nucleoside permease  36.75 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25339  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4184  purine nucleoside permease  33.72 
 
 
356 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2226  purine nucleoside permease  32.34 
 
 
575 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.822205  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0564  purine nucleoside permease  32.21 
 
 
337 aa  152  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1764  putative purine nucleoside permease protein  32.3 
 
 
344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.319131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1321  purine nucleoside permease  32.97 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.435473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0849  purine or other phosphorylase family 1  33.22 
 
 
329 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2814  purine nucleoside permease  31.39 
 
 
338 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0917  Purine nucleoside permease-like protein  28.62 
 
 
342 aa  90.1  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155546  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0774  phosphorylase, putative  28.52 
 
 
333 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>