14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1737 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1737  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2045  hypothetical protein  97.12 
 
 		 222 aa  390  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4256  hypothetical protein  80.1 
 
 		 230 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00915511 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4782  hypothetical protein  80.88 
 
 		 230 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0577  hypothetical protein  67.38 
 
 		 209 aa  277  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2895  hypothetical protein  61.7 
 
 		 214 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2887  hypothetical protein  62.7 
 
 		 214 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0248177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2795  hypothetical protein  61.62 
 
 		 214 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2398  hypothetical protein  60.87 
 
 		 218 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.54266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2905  alpha amylase domain-containing protein  29.65 
 
 		 185 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.450058 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1919  hypothetical protein  29.63 
 
 		 209 aa  86.7  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2130  hypothetical protein  26.97 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00274395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1924  hypothetical protein  32.8 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1011  hypothetical protein  28.02 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>