43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0816 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0816  purine nucleoside permease  100 
 
 		 349 aa  726    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0746  purine nucleoside permease  98.57 
 
 		 349 aa  717    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119389  normal  0.778761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0799  putative purine nucleoside permease protein  91.1 
 
 		 346 aa  622  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3369  purine nucleoside permease  59.16 
 
 		 357 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4629  purine nucleoside permease  59.49 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00101608  normal  0.109746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0815  purine nucleoside permease  59.29 
 
 		 371 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4706  purine nucleoside permease  58.52 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0697594  normal  0.247967 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5237  purine nucleoside permease  58.52 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0745  purine nucleoside permease  58.97 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.64688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0845  CNT family concentrative nucleoside/H+ anitporter  58.52 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673784  normal  0.0511609 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3010  purine nucleoside permease  58.52 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435563  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4914  purine nucleoside permease  58.52 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.78554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5356  purine nucleoside permease  58.52 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1835  putative lipoprotein  59.03 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0822  putative lipoprotein  59.03 
 
 		 353 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0409  purine nucleoside permease family protein  59.03 
 
 		 353 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0507  purine nucleoside permease family protein  59.03 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2138  putative lipoprotein  59.03 
 
 		 353 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2112  putative lipoprotein  58.84 
 
 		 353 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0289  purine nucleoside transporter  58.2 
 
 		 359 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.859349  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1471  putative lipoprotein  59.03 
 
 		 353 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4530  purine nucleoside permease  57.56 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0798  putative purine nucleoside permease protein  58.33 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3758  purine nucleoside permease  52.58 
 
 		 340 aa  346  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3859  purine nucleoside permease  52.58 
 
 		 343 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4123  purine nucleoside permease, putative  52.58 
 
 		 343 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1496  putative purine nucleoside permease  48.53 
 
 		 370 aa  302  7.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1619  purine nucleoside permease  48.23 
 
 		 345 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10683  purine nucleoside permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00810)  43.77 
 
 		 396 aa  249  4e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1872  Purine nucleoside permease protein  42.35 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31020  purine nucleoside permease  39.23 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171142  normal  0.23144 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76929  purine nucleoside permease  39.55 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.638652 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1232  purine nucleoside permease  36.91 
 
 		 354 aa  189  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3260  purine nucleoside permease  35.98 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4184  purine nucleoside permease  30.64 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2226  purine nucleoside permease  33.03 
 
 		 575 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.822205  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1764  putative purine nucleoside permease protein  31.79 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.319131  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0564  purine nucleoside permease  30.86 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1321  purine nucleoside permease  31.82 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.435473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0849  purine or other phosphorylase family 1  31.11 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0917  Purine nucleoside permease-like protein  26.01 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0774  phosphorylase, putative  26.01 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2814  purine nucleoside permease  27.53 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>