16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4265 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4265  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3577  hypothetical protein  70 
 
 		 80 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.604321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1716  hypothetical protein  67.09 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1722  hypothetical protein  74.68 
 
 		 79 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2273  hypothetical protein  72.88 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179364  normal  0.226669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2686  hypothetical protein  67.21 
 
 		 81 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2965  hypothetical protein  59.62 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0119  hypothetical protein  48.1 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4740  hypothetical protein  48.72 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0684  hypothetical protein  60.42 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0092  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  43.66 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0475  hypothetical protein  38.75 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0604  hypothetical protein  48 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0050  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0279  hypothetical protein  57.14 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.778649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0981  hypothetical protein  29.33 
 
 		 94 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644119  normal  0.810394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>