16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3593 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3593  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  310  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3101  hypothetical protein  88.81 
 
 		 148 aa  259  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3361  hypothetical protein  90 
 
 		 149 aa  253  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2361  hypothetical protein  86.57 
 
 		 148 aa  227  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309866  normal  0.446148 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0041  hypothetical protein  42.76 
 
 		 174 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0720  hypothetical protein  44.76 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.295574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5170  hypothetical protein  41.26 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0785  hypothetical protein  43.36 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0996  hypothetical protein  45.97 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0884  hypothetical protein  45.08 
 
 		 152 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0212  hypothetical protein  42.19 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0143  hypothetical protein  38.36 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.470463  normal  0.546705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6894  hypothetical protein  43.1 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00106592  normal  0.0638808 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3386  hypothetical protein  34.48 
 
 		 315 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.31527 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2154  hypothetical protein  33.94 
 
 		 291 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1401  hypothetical protein  28.75 
 
 		 283 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.961468  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>