15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0720 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0720  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  310  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.295574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5170  hypothetical protein  78.95 
 
 		 152 aa  257  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0785  hypothetical protein  77.33 
 
 		 174 aa  256  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527511 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0143  hypothetical protein  73.51 
 
 		 158 aa  241  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.470463  normal  0.546705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0884  hypothetical protein  84.62 
 
 		 152 aa  238  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0996  hypothetical protein  79.85 
 
 		 152 aa  235  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0212  hypothetical protein  77.33 
 
 		 151 aa  233  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0041  hypothetical protein  46.72 
 
 		 174 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6894  hypothetical protein  46.38 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00106592  normal  0.0638808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3361  hypothetical protein  45.27 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3593  hypothetical protein  46.83 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3101  hypothetical protein  44.19 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2361  hypothetical protein  44.7 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309866  normal  0.446148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2154  hypothetical protein  34.23 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>