16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0996 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0996  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  312  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5170  hypothetical protein  83.55 
 
 		 152 aa  269  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0884  hypothetical protein  93.08 
 
 		 152 aa  261  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0785  hypothetical protein  79.33 
 
 		 174 aa  261  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527511 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0720  hypothetical protein  77.63 
 
 		 152 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.295574 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0143  hypothetical protein  68.87 
 
 		 158 aa  236  5.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.470463  normal  0.546705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0212  hypothetical protein  74.17 
 
 		 151 aa  227  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6894  hypothetical protein  48.61 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00106592  normal  0.0638808 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0041  hypothetical protein  47.45 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3361  hypothetical protein  43.94 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3593  hypothetical protein  45.97 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3101  hypothetical protein  43.41 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2361  hypothetical protein  44.7 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309866  normal  0.446148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2154  hypothetical protein  35.45 
 
 		 291 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3386  hypothetical protein  33.04 
 
 		 315 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.31527 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2011  hypothetical protein  31.76 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>