15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3101 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3101  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  310  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3593  hypothetical protein  89.47 
 
 		 148 aa  259  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3361  hypothetical protein  88.46 
 
 		 149 aa  248  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2361  hypothetical protein  91.04 
 
 		 148 aa  235  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309866  normal  0.446148 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0041  hypothetical protein  42.76 
 
 		 174 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0720  hypothetical protein  43.75 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.295574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5170  hypothetical protein  40.28 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0785  hypothetical protein  43.97 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527511 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0143  hypothetical protein  39.73 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.470463  normal  0.546705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0996  hypothetical protein  44.35 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0212  hypothetical protein  41.86 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0884  hypothetical protein  44.26 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6894  hypothetical protein  39.73 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00106592  normal  0.0638808 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3386  hypothetical protein  36.21 
 
 		 315 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.31527 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2154  hypothetical protein  34.48 
 
 		 291 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>